Protein–RNA interactions for Protein: A7KBS4

Zscan4d, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4dA7KBS4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Zscan4dA7KBS4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Zscan4dA7KBS4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Zscan4dA7KBS4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Zscan4dA7KBS4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Zscan4dA7KBS4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Zscan4dA7KBS4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Zscan4dA7KBS4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Zscan4dA7KBS4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Zscan4dA7KBS4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zscan4dA7KBS4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms