Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms