Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubb1A2AQ07 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms