Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms