Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP4

Serpinb6c, Serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb6cW4VSP4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Serpinb6cW4VSP4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms