Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms