Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms