Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav3Q9R0C8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav3Q9R0C8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms