Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copg1Q9QZE5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms