Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms