Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf11Q9QYK7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf11Q9QYK7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf11Q9QYK7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf11Q9QYK7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf11Q9QYK7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf11Q9QYK7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf11Q9QYK7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf11Q9QYK7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf11Q9QYK7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf11Q9QYK7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf11Q9QYK7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf11Q9QYK7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf11Q9QYK7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf11Q9QYK7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf11Q9QYK7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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