Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nphp1Q9QY53 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nphp1Q9QY53 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nphp1Q9QY53 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nphp1Q9QY53 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nphp1Q9QY53 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nphp1Q9QY53 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nphp1Q9QY53 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nphp1Q9QY53 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nphp1Q9QY53 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nphp1Q9QY53 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nphp1Q9QY53 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nphp1Q9QY53 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nphp1Q9QY53 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nphp1Q9QY53 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nphp1Q9QY53 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nphp1Q9QY53 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms