Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolkQ9QUG2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms