Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms