Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Nectin3Q9JLB9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Nectin3Q9JLB9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Nectin3Q9JLB9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Nectin3Q9JLB9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Nectin3Q9JLB9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Nectin3Q9JLB9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Nectin3Q9JLB9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Nectin3Q9JLB9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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Nectin3Q9JLB9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Nectin3Q9JLB9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Nectin3Q9JLB9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Nectin3Q9JLB9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Nectin3Q9JLB9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nectin3Q9JLB9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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