Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rfx5Q9JL61 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rfx5Q9JL61 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rfx5Q9JL61 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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