Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Upk3aQ9JKX8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Upk3aQ9JKX8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms