Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms