Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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