Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms