Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg7Q9D906 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms