Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrs1Q9CYH6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms