Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sugt1Q9CX34 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sugt1Q9CX34 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms