Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms