Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms