Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms