Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ino80bQ99PT3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms