Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ5

Col25a1, Collagen alpha-1(XXV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col25a1Q99MQ5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col25a1Q99MQ5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms