Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TirapQ99JY1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TirapQ99JY1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TirapQ99JY1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TirapQ99JY1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TirapQ99JY1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TirapQ99JY1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TirapQ99JY1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TirapQ99JY1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TirapQ99JY1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TirapQ99JY1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TirapQ99JY1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TirapQ99JY1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TirapQ99JY1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TirapQ99JY1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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