Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl3Q91YH5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms