Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lims2Q91XD2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms