Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmcd1Q8VEE1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmcd1Q8VEE1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmcd1Q8VEE1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmcd1Q8VEE1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmcd1Q8VEE1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmcd1Q8VEE1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmcd1Q8VEE1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms