Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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