Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim29Q8R2Q0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim29Q8R2Q0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms