Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrrtm1Q8K377 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm1Q8K377 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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