Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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