Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV2

Tph2, Tryptophan 5-hydroxylase 2, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph2Q8CGV2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Tph2Q8CGV2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Tph2Q8CGV2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tph2Q8CGV2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Tph2Q8CGV2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Tph2Q8CGV2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Tph2Q8CGV2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tph2Q8CGV2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tph2Q8CGV2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tph2Q8CGV2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms