Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms