Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc2Q8BKV1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gpc2Q8BKV1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gpc2Q8BKV1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms