Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim65Q8BFW4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim65Q8BFW4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms