Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ2

Rnf168, E3 ubiquitin-protein ligase RNF168, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf168Q80XJ2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf168Q80XJ2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf168Q80XJ2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf168Q80XJ2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf168Q80XJ2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf168Q80XJ2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf168Q80XJ2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf168Q80XJ2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf168Q80XJ2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms