Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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