Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma8aQ80VM8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms