Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2eQ80UW8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms