Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms