Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms