Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms