Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms