Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Scn4bQ7M729 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Scn4bQ7M729 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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