Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mindy1Q76LS9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mindy1Q76LS9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms